分居三个月不可以自动离婚，具体如下：
1、离婚只有通过到婚姻登记处办理协议离婚和起诉离婚两种方式，没有自动离婚这一途径；
2、男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民提出离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；
3、感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第三十二条 男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民提出离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：
一、重婚或有配偶者与他人同居的；
二、实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的；
三、有、吸毒等恶习屡教不改的；
四、因感情不和分居满二年的；
五、其他导致夫妻感情破裂的情形。一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的，应准予离婚。